在中央空調維修保養中，冷卻系統中的微生物處理最為頭痛，生長在冷卻系統中的大多數微生物受到剛性細胞壁的束縛， 細胞壁賦予生物體特有的形狀并提供機械強度，緊接在細胞壁內部的是細胞膜，其起細胞滲透屏障的作用，屏障允許細胞濃縮合意的化學物質，如營養素，并排除或排泄有毒或有害的化學物質，如廢物，可以在膜上建立幾個數量級的濃度梯度，所有的細胞必須花費大量的代謝能量來維持最佳的內部條件， 所有微生物的一個基本特征是能夠在惡劣和變化的環境中保持細胞的必要組織和完整性。
在微生物細胞中使用的基本組成部分，以及最大量需要的組成部分是碳，氮和磷。微生物在獲得碳的方法上有所不同。 綠藻，藍細菌和某些細菌可利用二氧化碳作為唯一碳源并將其轉化（“固定”）為細胞碳化合物。 大多數細菌，酵母和霉菌需要預先形成的碳化合物，并使用從非常簡單到非常復雜的有機分子。 為了滿足氮的需求，微生物“固定”大氣氮或利用環境中存在的胺，亞硝酸鹽和硝酸鹽。 天然存在的和合成的無機和有機磷酸鹽可用于滿足微生物磷酸鹽的要求。
微生物已經開發出許多方式從周圍環境中提取能量。 藻類和其他光合生物捕獲來自太陽的光能。 無機化學品，如氨，硫和氫，可被某些細菌氧化釋放能量。 更常見的是，細菌，酵母菌和霉菌釋放儲存在有機化合物（如糖，蛋白質，脂肪，油，有機酸和醇）中的化學能。
在中央空調維修保養中，好氧生物利用氧氣驅動釋放化學能量的氧化， 厭氧菌不使用氧氣，但可以用硫酸鹽或硝酸鹽等分子代替氧氣。 在無氧能量產生過程中，這些氧化分子被還原，形成硫化物或氮氣。 當沒有可用的氧化劑時，一些厭氧菌仍然可以產生能量，盡管效率較低，通過將一半底物分子的氧化偶聯到另一半的還原上。 通常，這種“發酵”反應的副產物是各種有機酸。
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